枯水季节水量减少，容易发生涝灾 水土流失的首要后果是使枯水季节水量减少，严重的是水源枯竭，河道断流，具体表现在两个方面：第一，使土壤蓄水量减少。土壤颗粒间的空隙占土壤总体积的30~50%，空隙是水份存在的空间，是涵养水源的关键，由于土壤随水而去，贮水空间就随之丧失，土壤的蓄水量也因此减少，从水文角度讲，增强了径流的年内变化，使洪水季节水更多，枯水季节水更少。第二，水土流失使得梯田、水塘、水凼、水库、湖泊、河道等发生淤积，蓄水容积减小，蓄水量也相应减少，也同样使汛期水更多，枯季水更少。因此，水土流失容易造成涝灾。
增加地表径流，加剧洪水泛滥 水土流失使枯水季节水量减少，但在洪水季节恰恰相反。水土流失严重的地区，植被大部分遭到了破坏，同时，山区更容易发生水土流失。当暴雨发生时，由于地面坡度大，植被不够，坡面截流能力较差，土壤表层涵水能力低，使得降雨强度远远大于土壤入渗速度，雨水来不及入渗，迅速大量产流，瞬时形成山洪，洪水过程与暴雨过程相似，陡涨陡落，历时短暂，凶猛的洪水夹杂泥沙倾泻而下，使下游人民的生命财产遭受严重损失。
造成河库淤塞，降低水利工程的效益 由于表层土壤裸露，在水力的侵蚀下，大量泥沙随地表径流流向塘库、江河，一方面淤积的泥沙减少了库容，削弱了水库的防洪能力，减少水库的使用寿命，严重时易造成漫坝、垮坝等灾害，另一方面造成沟渠江河河床拾高，严重影响行洪能力，致使洪水宣泄不畅，水位上涨，因此经常出现10年一遇的流量20年一遇的水位现象。
容易引发山体滑坡、泥石流等灾害 由于植被破坏、径流改变，土壤乃至地质结构受到影响，一遇暴雨，极易形成山体滑坡和泥石流，造成山洪灾害。滑坡、泥石流等灾害除了冲毁房屋、道路、电力通讯等设施外，也将破坏农田、水塘、水凼、水库等水利设施，严重的还会影响航运，使河道断流。
水环境质量下降 由于洪水增大，发生次数增加，表层土壤以泥沙形式进入水体，水体中含沙量增加，增加了水的浊度。同时，流失的土壤中含有大量的有机质及残存的农药、肥料等物质，这些物质随土壤一起进入水体，使水体的面源污染加大。水土流失越严重，进入水体的污染物就越多，水污染越严重；如前所述，水土流失使水库、湖泊、河道等发生淤积，同时，枯水季节水量减少，因此，造成水体的稀释自净能力下降，水环境容量减少，水污染速度加快。