住院证明是由医院开具的，由主治医生开具证明，再由主任签字，医院盖章即可。1、去住院的医院找你的主管大夫就可以开了，只要你住过院就一定会给你开住院证明的。2、新农合报销过程是：新农合医保方面一般是等出院后拿着身份证，农合医疗证，户口本，住院病历复印件，用药清单，出院证明等去当地新农合管理中心报销就行了。